Os dados contidos nos discos rígidos são organizados em ficheiros e directórios. Cada sistema operativo tem o seu próprio sistema de ficheiros. Estes sistemas de ficheiros têm uma forma complexa e eficiente de organizar os dados, mas quando ocorrem erros devido a: manipulação inadequada (eliminação acidental de pastas ou documentos), instalação de programas que afectam o sistema de ficheiros, partições de disco, ataques de vírus, etc., este sistema de ficheiros pode tornar-se corrompido e ocorre uma falha que impede o acesso aos dados.
Nas plataformas Windows normalmente se utilizam três sistemas de arquivos:
- FAT: File allocatiion table
- FAT32: 32-bit file allocation table
- NTFS: NT File System
No mundo do Macintosh existem dois sistemas:
- Macintosh HFS: Hierarchical File System
- HFS+ ou também chamado Mac OS Extended
A plataforma Unix utiliza:
- UFS: Unix File System
Plataforma Linux:
- VFS: Virtual File-System